Магистерскую диссертацию Жуковский защитил в 1876. А в 1882 за исследование «О прочности движения» ему была присуждена докторская степень в прикладной математике. В 1885 он был утвержден в должности приват-доцента, а в 1886 в должности экстраординарного профессора кафедры механики Московского университета. С 1887 руководил кафедрой механики МВТУ (с 1879 был сверхштатным профессором). В Московском университете и МВТУ под руководством Жуковского были организованы лаборатории, в которых велись самые разнообразные исследования в области механики.